ran make specs

Author: Michael Joseph

nipype/algorithms/tests/test_auto_ACompCor.py

@@ -25,8 +25,8 @@ def test_ACompCor_inputs():
         realigned_file=dict(mandatory=True, ),
         regress_poly_degree=dict(usedefault=True, ),
         repetition_time=dict(),
-        save_metadata=dict(),
-        save_pre_filter=dict(),
+        save_metadata=dict(usedefault=True, ),
+        save_pre_filter=dict(usedefault=True, ),
         use_regress_poly=dict(
             deprecated='0.15.0',
             new_name='pre_filter',

nipype/algorithms/tests/test_auto_TCompCor.py

@@ -26,8 +26,8 @@ def test_TCompCor_inputs():
         realigned_file=dict(mandatory=True, ),
         regress_poly_degree=dict(usedefault=True, ),
         repetition_time=dict(),
-        save_metadata=dict(),
-        save_pre_filter=dict(),
+        save_metadata=dict(usedefault=True, ),
+        save_pre_filter=dict(usedefault=True, ),
         use_regress_poly=dict(
             deprecated='0.15.0',
             new_name='pre_filter',

nipype/interfaces/fsl/tests/test_auto_EddyQuad.py

@@ -12,25 +12,25 @@ def test_EddyQuad_inputs():
             usedefault=True,
         ),
         bval_file=dict(
-            argstr='--bvals=%s',
+            argstr='--bvals %s',
             mandatory=True,
         ),
-        bvec_file=dict(argstr='--bvecs=%s', ),
+        bvec_file=dict(argstr='--bvecs %s', ),
         environ=dict(
             nohash=True,
             usedefault=True,
         ),
-        field=dict(argstr='--field=%s', ),
+        field=dict(argstr='--field %s', ),
         idx_file=dict(
-            argstr='--eddyIdx=%s',
+            argstr='--eddyIdx %s',
             mandatory=True,
         ),
         mask_file=dict(
-            argstr='--mask=%s',
+            argstr='--mask %s',
             mandatory=True,
         ),
         output_dir=dict(
-            argstr='--output-dir=%s',
+            argstr='--output-dir %s',
             name_source=['base_name'],
             name_template='%s.qc',
         ),
@@ -39,7 +39,7 @@ def test_EddyQuad_inputs():
             argstr='--eddyParams=%s',
             mandatory=True,
         ),
-        slice_spec=dict(argstr='--slspec=%s', ),
+        slice_spec=dict(argstr='--slspec %s', ),
         verbose=dict(argstr='--verbose', ),
     )
     inputs = EddyQuad.input_spec()

nipype/interfaces/spm/tests/test_auto_Level1Design.py

@@ -10,6 +10,7 @@ def test_Level1Design_inputs():
             mandatory=True,
         ),
         factor_info=dict(field='fact', ),
+        flags=dict(),
         global_intensity_normalization=dict(field='global', ),
         interscan_interval=dict(
             field='timing.RT',